RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 LONRF3Q496Y0 759 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 COX20Q5RI15 118 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 LILRB2Q8N423 598 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF358Q9NW07 568 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 STIM2Q9P246 746 aa7.37□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF20Q5VTR2 975 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FRMD6Q96NE9 622 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 POLIQ9UNA4 740 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 M0R2N6 131 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 OPLAHO14841 1288 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 EMP3P54852 163 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPRNQ16849 979 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZBTB33Q86T24 672 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 TNS4Q8IZW8 715 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.36□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 KLF4O43474 513 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 MASP1P48740 699 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 C8orf48Q96LL4 319 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 Q3C1V9 767 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC189A1A4V9 331 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 RIMBP2O15034 1052 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP4Q13107 963 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAB33AQ14088 237 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PI16Q6UXB8 463 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 JAMLQ86YT9 394 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP31Q70CQ4 1352 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 A0A1W2PRU2 124 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF40O75150 1001 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 GJD3Q8N144 294 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 APPBP2Q92624 585 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.34□□□□□ -1.23
CSNK1G3-210ENST00000521364 UBE4AQ14139 1066 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 TKFCQ3LXA3 575 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 CSRNP1Q96S65 589 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNAJC7Q99615 494 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNTN3Q9P232 1028 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SNPHO15079 494 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 FBF1Q8TES7 1133 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.33□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 GNALP38405 381 aa7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 NBPF14Q5TI25 921 aa7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.32□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 F6X3S4 739 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 JUNDP17535 347 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 IL17RAQ96F46 866 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPG7Q9UQ90 795 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 ERBB3P21860 1342 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 TBCELQ5QJ74 424 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms