RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	EYA1	Q99502	592 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945		H0YHG0	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KDM4A	O75164	1064 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MAP2K2	P36507	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MAGEA9	P43362	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TSC1	Q92574	1164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	GNPAT	O15228	680 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CCP110	O43303	1012 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CDC45	O75419	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	IGHA1	P01876	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ERCC3	P19447	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	APLP1	P51693	650 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TMF1	P82094	1093 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	SRL	Q86TD4	932 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	PSMD1	Q99460	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ELP1	O95163	1332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	LAMC1	P11047	1609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	BCAR3	O75815	825 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	NEFH	P12036	1026 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STAU2-209	ENST00000520945	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms