RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.89□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C5P01031 1676 aa6.89□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.89□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ITGB4P16144 1822 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NEFMP07197 916 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP6V1AP38606 617 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTGER2P43116 358 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KCNQ4P56696 695 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.88□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MRC1P22897 1456 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAP3K5Q99683 1374 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SSFA2P28290 1259 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RALBP1Q15311 655 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARXQ96QS3 562 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C4BP0C0L5 1744 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.87□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM205CA6NFA0 338 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAP3K7O43318 606 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FCHSD2O94868 740 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRKAR2BP31323 418 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FOSBP53539 338 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TEFQ10587 303 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GNPATO15228 680 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PHF14O94880 888 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OSBPP22059 807 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ITPK1Q13572 414 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EPAS1Q99814 870 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LGR6Q9HBX8 967 aa6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.84□□□□□ -1.31
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPS6KA4O75676 772 aa6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FBXW7Q969H0 707 aa6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SYT17Q9BSW7 474 aa6.83□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 STARD3NLO95772 234 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RFC4P35249 363 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MSL1Q68DK7 614 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IL17REQ8NFR9 667 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.82□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BTBD11A6QL63 1104 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC39A6Q13433 755 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF790Q6PG37 636 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TJP1Q07157 1748 aa6.81□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A087WZG4 1122 aa6.8□□□□□ -1.32
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms