RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517246.1

RNA5SP415-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 415, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP415, Length 115 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP415-201ENST00000517246 HLFQ16534 295 aa22.59■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.59■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.59■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.59■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 SBF1O95248 1867 aa22.58■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 MYL6BP14649 208 aa22.58■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
RNA5SP415-201ENST00000517246 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 RGL2O15211 777 aa22.57■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 ST5P78524 1137 aa22.57■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.57■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 NUP98P52948 1817 aa22.57■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.56■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 FAM177BA6PVY3 158 aa22.55■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.55■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 RASSF7Q02833 373 aa22.54■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 RNF181Q9P0P0 153 aa22.54■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.53■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 CHL1O00533 1208 aa22.53■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.53■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.53■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 ERBB4Q15303 1308 aa22.53■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.52■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 SRGNP10124 158 aa22.52■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.52■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RNA5SP415-201ENST00000517246 CACNA1SQ13698 1873 aa22.51■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 PDIA6Q15084 440 aa22.51■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 KRT24Q2M2I5 525 aa22.51■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 CCDC184Q52MB2 194 aa22.51■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 SLX4Q8IY92 1834 aa22.51■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 APAF1O14727 1248 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 KIF3CO14782 793 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 C21orf2O43822 256 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 ANXA1P04083 346 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 PROSER3Q2NL68 480 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 STYK1Q6J9G0 422 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 NECTIN2Q92692 538 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 MASTLQ96GX5 879 aa22.5■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.49■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 PRELPP51888 382 aa22.49■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 CNKSR1Q969H4 720 aa22.49■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 NFKBIEO00221 500 aa22.48■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 GPTP24298 496 aa22.48■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 LMNB1P20700 586 aa22.47■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.47■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.46■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 CFAP44Q96MT7 982 aa22.46■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.46■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.45■■□□□ 1.19
RNA5SP415-201ENST00000517246 NPR1P16066 1061 aa22.45■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.45■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.45■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 NYXQ9GZU5 481 aa22.45■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 ERFEQ4G0M1 354 aa22.44■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 SUSD4Q5VX71 490 aa22.44■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 ABCC12Q96J65 1359 aa22.44■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 COPS6Q7L5N1 327 aa22.43■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.43■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 MBIPQ9NS73 344 aa22.43■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZNF853P0CG23 659 aa22.42■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.41■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.41■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.41■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.41■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 HOXB7P09629 217 aa22.4■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.4■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.4■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RNA5SP415-201ENST00000517246 ANP32CO43423 234 aa22.39■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 NTSR2O95665 410 aa22.39■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 SOGA3Q5TF21 947 aa22.39■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.39■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 IFT57Q9NWB7 429 aa22.39■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.38■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 GNAI1P63096 354 aa22.38■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 PARP10Q53GL7 1025 aa22.38■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.38■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 RRAGCQ9HB90 399 aa22.38■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 TOMM70O94826 608 aa22.37■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 ALDH1B1P30837 517 aa22.37■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 CRY2Q49AN0 593 aa22.37■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 OLFM4Q6UX06 510 aa22.37■■□□□ 1.17
RNA5SP415-201ENST00000517246 MRS2Q9HD23 443 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.5 ms