RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KANK3Q6NY19 840 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 POTEAQ6S8J7 498 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RHPN1Q8TCX5 695 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HINFPQ9BQA5 517 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PHF20L1A8MW92 1017 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GDF11O95390 407 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CD33P20138 364 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IRS1P35568 1242 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CFAP70Q5T0N1 1121 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EDARADDQ8WWZ3 215 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PHACTR1Q9C0D0 580 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZMYND15Q9H091 742 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MARK1Q9P0L2 795 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GGA1Q9UJY5 639 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRR12Q9ULL5 1215 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EFSO43281 561 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C21orf2O43822 256 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RFX1P22670 979 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AMPD1P23109 780 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ADH6P28332 368 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GSK3AP49840 483 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HIF1AQ16665 826 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM200AQ8TCP9 573 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C7orf43Q8WVR3 580 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NEURL1BA8MQ27 555 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PIK3R2O00459 728 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EPXP11678 715 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IGFBP4P22692 258 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NGLY1Q96IV0 654 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SUSD3Q96L08 255 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ARXQ96QS3 562 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RRAGCQ9HB90 399 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 STRN4Q9NRL3 753 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NEUROD1Q13562 356 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RTN1Q16799 776 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CDCA8Q53HL2 280 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCTD17Q8N5Z5 321 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BTBD6Q96KE9 485 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CEP63Q96MT8 703 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BRD7Q9NPI1 651 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HCN2Q9UL51 889 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FOXO3O43524 673 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LGR5O75473 907 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ALAS2P22557 587 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WEE1P30291 646 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNQ4P56696 695 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TYRO3Q06418 890 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CHSY3Q70JA7 882 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SYT9Q86SS6 491 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FCHSD1Q86WN1 690 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF280CQ8ND82 737 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 VTI1AQ96AJ9 217 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KLF15Q9UIH9 416 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNH4Q9UQ05 1017 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SIN3BO75182 1162 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SPEM2Q0P670 501 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IER5Q5VY09 327 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SERPINA10Q9UK55 444 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GNB5O14775 395 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IGHA1P01876 353 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DGKGP49619 791 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ELOA3BQ3SY89 546 aa3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms