RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515964.1

RNU6-1129P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1129, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1129P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ATG7O95352 703 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BMP4P12644 408 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PRMT3O60678 531 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CD33P20138 364 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MAP2K3P46734 347 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CTBSQ01459 385 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MAP3K10Q02779 954 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 POTEAQ6S8J7 498 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 WEE1P30291 646 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TNP2Q05952 138 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARID3AQ99856 593 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FAM157BP0CG42 384 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ACDQ96AP0 544 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C2CD2LO14523 706 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FOXO3O43524 673 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SUSD3Q96L08 255 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 STRN4Q9NRL3 753 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BCRP11274 1271 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RTN1Q16799 776 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CEP63Q96MT8 703 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HCN2Q9UL51 889 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MARK1Q9P0L2 795 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 EFSO43281 561 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HIF1AQ16665 826 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BRD7Q9NPI1 651 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KLK14Q9P0G3 267 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARHGEF15O94989 841 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DGKZQ13574 1117 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GGA1Q9UJY5 639 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TYRO3Q06418 890 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LAMC2Q13753 1193 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GRIN2CQ14957 1233 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 OCLNQ16625 522 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 OIP5O43482 229 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FAM182BQ5T319 152 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARAFP10398 606 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BCS1LQ9Y276 419 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ADH6P28332 368 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SLC30A3Q99726 388 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SLAIN2Q9P270 581 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 AMPD1P23109 780 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ATP2B4P23634 1241 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SPEM2Q0P670 501 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MYO19Q96H55 970 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IDH3AP50213 366 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-1129P-201ENST00000515964 COX20Q5RI15 118 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms