RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 ZIC5Q96T25 663 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 EML1O00423 815 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 ARAFP10398 606 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 FAM196BA6NMK8 535 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 PIK3R2O00459 728 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 IRS1P35568 1242 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 GSK3AP49840 483 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 SEC13P55735 322 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 TNP2Q05952 138 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 POTEAQ6S8J7 498 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.1□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 GRIN2CQ14957 1233 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 HIF1AQ16665 826 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 STK32AQ8WU08 396 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRBVA-201ENST00000498804 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 C2CD2LO14523 706 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 ADH6P28332 368 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 CTBSQ01459 385 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 MARK1Q9P0L2 795 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 SLAIN2Q9P270 581 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 GGA1Q9UJY5 639 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.08□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 IGHA1P01876 353 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 C14orf37Q86TY3 774 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 STRN4Q9NRL3 753 aa6.07□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 EFSO43281 561 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 CD33P20138 364 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 AMPD1P23109 780 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.06□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 EPXP11678 715 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 NEUROD1Q13562 356 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 RRAGCQ9HB90 399 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 IGFBP4P22692 258 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 HINFPQ9BQA5 517 aa6.04□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 WEE1P30291 646 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 BTBD6Q96KE9 485 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 KLF15Q9UIH9 416 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 BCS1LQ9Y276 419 aa6.03□□□□□ -1.44
TRBVA-201ENST00000498804 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 GNB5O14775 395 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 ALAS2P22557 587 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 KCNQ4P56696 695 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 OCLNQ16625 522 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 NGLY1Q96IV0 654 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 SUSD3Q96L08 255 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 EFCC1Q9HA90 598 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 BRD7Q9NPI1 651 aa6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 CARNS1A5YM72 827 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 FOXO3O43524 673 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 PRMT3O60678 531 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 SIN3BO75182 1162 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBVA-201ENST00000498804 RTN1Q16799 776 aa6.01□□□□□ -1.45
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