RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 SETDB2Q96T68 719 aa23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 TGFB2P61812 414 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPR162Q16538 588 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPYL6Q8N831 410 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A0G2JLW4 131 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 COPS6Q7L5N1 327 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPEP1P16444 411 aa23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF521Q96K83 1311 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.293e-8■■■■□ 26.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1-207ENST00000497453 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNBD1Q8NA66 436 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 HYPKQ9NX55 129 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP10DQ9P241 1426 aa23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNA3P22001 575 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHRNA5P30532 468 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 GOLGA2Q08379 1002 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPHP1O15259 732 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM177BA6PVY3 158 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPTP24298 496 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 ST5P78524 1137 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRIN3BO60391 1043 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 PIM2Q9P1W9 311 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUP98P52948 1817 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDE6BP35913 854 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 C2CD5Q86YS7 1000 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLBD2Q8NHP8 589 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 BCS1LQ9Y276 419 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 H0YIN7 160 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 VAMP4O75379 141 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 SUSD4Q5VX71 490 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 NYXQ9GZU5 481 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCIRG1Q13488 830 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 PARP10Q53GL7 1025 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 STK31Q9BXU1 1019 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 E9PSI1 815 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
UBE2Q1-207ENST00000497453 NTSR2O95665 410 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 UTRNP46939 3433 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERFEQ4G0M1 354 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 NLRP10Q86W26 655 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC12Q96J65 1359 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC4A2P04920 1241 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLFN5Q08AF3 891 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.263e-8■□□□□ 9.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 SRGNP10124 158 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 YY1P25490 414 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 G2E3Q7L622 706 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTLL6Q8N841 843 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2Q1-207ENST00000497453 STYK1Q6J9G0 422 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms