RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 CASP7P55210 303 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 TAF1P21675 1872 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 LY75O60449 1722 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 TTC22Q5TAA0 569 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 KIF2CQ99661 725 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 IL25Q9H293 177 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 LAMB2P55268 1798 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 GNAI3P08754 354 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 MYD88Q99836 296 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-212ENST00000497037 C4AP0C0L4 1744 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 C4BP0C0L5 1744 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 GCKRQ14397 625 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SDSP20132 328 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 MTX1Q13505 466 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 LINS1Q8NG48 757 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 GRM8O00222 908 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNQ2O43526 872 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ALDH1L1O75891 902 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 PDE1AP54750 535 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SRGAP3O43295 1099 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SCN7AQ01118 1682 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SASH1O94885 1247 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SYNE4Q8N205 404 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 TOM1O60784 492 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 FOXO4P98177 505 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 HLFQ16534 295 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM5Q71RC9 77 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 C8orf37Q96NL8 207 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ITPK1Q13572 414 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM182BQ5T319 152 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 PLBD2Q8NHP8 589 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRCC1Q9C099 1032 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNQ4P56696 695 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RHPN1Q8TCX5 695 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 JCADQ9P266 1359 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 LRP5O75197 1615 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 EXOC5O00471 708 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 HSPA1LP34931 641 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 COL15A1P39059 1388 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 BARGINQ6ZT62 677 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 STAP2Q9UGK3 403 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 LAMA4Q16363 1823 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 H7C1W4 665 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 HMMRO75330 724 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 MX1P20591 662 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 CERKQ8TCT0 537 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-212ENST00000497037 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms