RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	EYA1	Q99502	592 aa		7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	IL2RB	P14784	551 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	DDB1	Q16531	1140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT24	Q2M2I5	525 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM161A	Q3B820	660 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	FLT4	P35916	1363 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CRB1	P82279	1406 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	NFAT5	O94916	1531 aa		7.41	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		7.4	□□□□□ -1.22
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		7.4	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		7.4	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCA3	Q99758	1704 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	RGS12	O14924	1447 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	FOSB	P53539	338 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	MCM10	Q7L590	875 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		7.39	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC37A3	O60309	1634 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	CHL1	O00533	1208 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	WFS1	O76024	890 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC4A3	P48751	1232 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAI1	P63096	354 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXK1	P85037	733 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP44	Q96MT7	982 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	LTN1	O94822	1766 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	COL18A1	P39060	1754 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		7.38	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	RTL1	A6NKG5	1358 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	KDR	P35968	1356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC4	O15439	1325 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SOCS7	O14512	581 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	DGAT1	O75907	488 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	AAMP	Q13685	434 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	PLPP6	Q8IY26	295 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	RGPD5	Q99666	1765 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	GLI3	P10071	1580 aa		7.37	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM37	O94972	964 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SMC5	Q8IY18	1101 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.36	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF16B	Q96L93	1317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		7.35	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	G2E3	Q7L622	706 aa		7.35	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		7.35	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23

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