RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 RTN1Q16799 776 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 HELQQ8TDG4 1101 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 MYO19Q96H55 970 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 KLK14Q9P0G3 267 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BRB1 525 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFRSF10BO14763 440 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 DGKZQ13574 1117 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ZIC5Q96T25 663 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 RUBCNLQ9H714 662 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 F11P03951 625 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM26DQ5JW98 314 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PNR3 127 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ICMTO60725 284 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 MPSTP25325 297 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 SUSD3Q96L08 255 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 BCS1LQ9Y276 419 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 THBS1P07996 1170 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 PGBD3Q8N328 593 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 STIM2Q9P246 746 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 VSIG8P0DPA2 414 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ECM1Q16610 540 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 IFT43Q96FT9 208 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB39O15060 712 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 PPFIA3O75145 1194 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 NPR3P17342 541 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGA6P23229 1130 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 DBN1Q16643 649 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM13AO94988 1023 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 HIF1AQ16665 826 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 EFHC2Q5JST6 749 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ATCAYQ86WG3 371 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 TREML1Q86YW5 311 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ABTB2Q8N961 1025 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC14CA4D256 554 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C1W4 665 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 MICAL2O94851 1124 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ZAP70P43403 619 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 IDH3AP50213 366 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP4P98171 946 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 IER5Q5VY09 327 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP8Q86W28 1048 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTB-211ENST00000489450 TYRO3Q06418 890 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP63Q96MT8 703 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 USP20Q9Y2K6 914 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 OPLAHO14841 1288 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 FZD6O60353 706 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 AAMPQ13685 434 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR152Q8TDT2 470 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR25O00155 361 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms