RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 MX1P20591 662 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 FIBPO43427 364 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 VGLL3A8MV65 326 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB22O15209 634 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 IL25Q9H293 177 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 PALD1Q9ULE6 856 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 PSME1Q06323 249 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 IP6K1Q92551 441 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 DRC7Q8IY82 874 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 NFAT5O94916 1531 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ORAI2Q96SN7 254 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 USP54Q70EL1 1684 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 DTNBO60941 627 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CUL4AQ13619 759 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 FEZ1Q99689 392 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 OGFRQ9NZT2 677 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CHMLP26374 656 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD7Q92527 254 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 TAF3Q5VWG9 929 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 CACNA1FO60840 1977 aa16.08■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.08■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 ZNF592Q92610 1267 aa16.08■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 TMEM51Q9NW97 253 aa16.08■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 PXDNQ92626 1479 aa16.08■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 PTGS1P23219 599 aa16.08■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 AP5Z1O43299 807 aa16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 SSH3Q8TE77 659 aa16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 BTBD11A6QL63 1104 aa16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 SRGAP3O43295 1099 aa16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ4P48050 445 aa16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 UBE2HP62256 183 aa16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 PROSER3Q2NL68 480 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 TPM3P06753 285 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 TEFQ10587 303 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 BEND3Q5T5X7 828 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 STAP2Q9UGK3 403 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 GCP02774 474 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 DNAAF4Q8WXU2 420 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 CTIFO43310 598 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 ADCY9O60503 1353 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 TNNT1P13805 278 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 LRMPQ12912 555 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 POLA2Q14181 598 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 ERICH4A6NGS2 130 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 CCDC192P0DO97 292 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 CAMK4Q16566 473 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 STX6O43752 255 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-212ENST00000488380 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms