RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 TSPYL4Q9UJ04 414 aa37.43■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 CEP350Q5VT06 3117 aa37.43■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 LMNB1P20700 586 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 LMOD3Q0VAK6 560 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 HLFQ16534 295 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 NGEFQ8N5V2 710 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 NMRK2Q9NPI5 230 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 TPTE2Q6XPS3 522 aa37.4■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 SRGNP10124 158 aa37.39■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 BABAM1Q9NWV8 329 aa37.39■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CHTF18-209ENST00000479976 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP37.38■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 STYK1Q6J9G0 422 aa37.38■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC146Q8IYE0 955 aa37.38■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 CNKSR1Q969H4 720 aa37.38■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 KDM2BQ8NHM5 1336 aa37.37■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 ERVV-1B6SEH8 477 aa37.37■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 NFKBIEO00221 500 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 C21orf2O43822 256 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 TOMM70O94826 608 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 MYL6BP14649 208 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 PRELPP51888 382 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 RUNDC1Q96C34 613 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 MASTLQ96GX5 879 aa37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 HSPA6P17066 643 aa37.35■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 NEUROD2Q15784 382 aa37.35■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 ADAMTS8Q9UP79 889 aa37.34■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa37.34■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 KIF6Q6ZMV9 814 aa37.33■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 TTLL7Q6ZT98 887 aa37.33■■■■□ 3.57
CHTF18-209ENST00000479976 FAM177BA6PVY3 158 aa37.32■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 ERBB4Q15303 1308 aa37.32■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa37.3■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 SLX4Q8IY92 1834 aa37.29■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 NUP98P52948 1817 aa37.29■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 NPR1P16066 1061 aa37.28■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 RRAGCQ9HB90 399 aa37.28■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 TRIM35Q9UPQ4 493 aa37.28■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa37.26■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 SOGA3Q5TF21 947 aa37.26■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 NYXQ9GZU5 481 aa37.26■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 ZBTB3Q9H5J0 574 aa37.26■■■■□ 3.56
CHTF18-209ENST00000479976 PDIA6Q15084 440 aa37.25■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 CACNA1SQ13698 1873 aa37.24■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 GLTPD2A6NH11 291 aa37.24■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 CHL1O00533 1208 aa37.24■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 LTBP3Q9NS15 1303 aa37.24■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 LRP10Q7Z4F1 713 aa37.23■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa37.22■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 C7orf43Q8WVR3 580 aa37.22■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 TAOK3Q9H2K8 898 aa37.22■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 GPTP24298 496 aa37.2■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 NUTM1Q86Y26 1132 aa37.2■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF34Q8IZ26 560 aa37.2■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
CHTF18-209ENST00000479976 ERFEQ4G0M1 354 aa37.19■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 UBN2Q6ZU65 1347 aa37.18■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 ALDH1B1P30837 517 aa37.18■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 PROSER3Q2NL68 480 aa37.18■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 TIAM2Q8IVF5 1701 aa37.18■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 DPY19L2Q6NUT2 758 aa37.17■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 ANXA1P04083 346 aa37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 SUSD4Q5VX71 490 aa37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 NECTIN2Q92692 538 aa37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 CRY2Q49AN0 593 aa37.15■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC93Q567U6 631 aa37.15■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC12Q96J65 1359 aa37.15■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 APLP1P51693 650 aa37.14■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 KRT24Q2M2I5 525 aa37.14■■■■□ 3.54
CHTF18-209ENST00000479976 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 FSTL1Q12841 308 aa37.13■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 PARP10Q53GL7 1025 aa37.12■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa37.12■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 COPS6Q7L5N1 327 aa37.11■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 CFAP44Q96MT7 982 aa37.11■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 NTSR2O95665 410 aa37.1■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 RTKN2Q8IZC4 609 aa37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 XAGE3Q8WTP9 111 aa37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 RIC1Q4ADV7 1423 aa37.09■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 APAF1O14727 1248 aa37.08■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 OLFM4Q6UX06 510 aa37.08■■■■□ 3.53
CHTF18-209ENST00000479976 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
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