RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	TOMM70	O94826	608 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	LMNB1	P20700	586 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	C21orf2	O43822	256 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.35	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	NFKBIE	O00221	500 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	RGL2	O15211	777 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	RIPK4	P57078	832 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-208	ENST00000468310	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	SRGN	P10124	158 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRELP	P51888	382 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	HLF	Q16534	295 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	MYL6B	P14649	208 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	CEP350	Q5VT06	3117 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	NUP98	P52948	1817 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PRKCZ-208	ENST00000468310	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.26	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	GLTPD2	A6NH11	291 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	NPR1	P16066	1061 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	APLP1	P51693	650 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	ERFE	Q4G0M1	354 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PRKCZ-208	ENST00000468310	FSTL1	Q12841	308 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	GPT	P24298	496 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	WDR90	Q96KV7	1748 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PRKCZ-208	ENST00000468310	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	PDIA6	Q15084	440 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANXA1	P04083	346 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	28.11	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHL1	O00533	1208 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	POTEC	B2RU33	542 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	NTSR2	O95665	410 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	HTRA3	P83110	453 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-208	ENST00000468310	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.08	■■■□□ 2.09

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