RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429254.1

LNCPRESS1-201, Transcript of lncRNA p53 regulated and ESC associated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LNCPRESS1, Length 756 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CHD4Q14839 1912 aa20.14■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCDC27Q2M243 656 aa20.13■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.12■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ERBB4Q15303 1308 aa20.12■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SERPINB2P05120 415 aa20.12■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 WWC1Q8IX03 1113 aa20.12■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANXA1P04083 346 aa20.11■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLC4A2P04920 1241 aa20.11■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.1■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PDIA6Q15084 440 aa20.1■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PROSER3Q2NL68 480 aa20.1■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.1■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.1■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.09■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 A0A0G2JLW4 131 aa20.09■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TGFB2P61812 414 aa20.09■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HLFQ16534 295 aa20.09■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.09■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DPEP1P16444 411 aa20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SETDB2Q96T68 719 aa20.08■□□□□ 0.81
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.08■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.07■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HOXB7P09629 217 aa20.07■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.07■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.06■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.06■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.06■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCER2I3L3R5 266 aa20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CHRNA5P30532 468 aa20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CACNA1SQ13698 1873 aa20.05■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 IL16Q14005 1332 aa20.04■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.04■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RGL2O15211 777 aa20.04■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FAM177BA6PVY3 158 aa20.03■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NPHP1O15259 732 aa20.03■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KCNA3P22001 575 aa20.03■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CNBD1Q8NA66 436 aa20.03■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.03■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GRIN3BO60391 1043 aa20.02■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 COPS6Q7L5N1 327 aa20.02■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 WDR63Q8IWG1 891 aa20.02■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 BCS1LQ9Y276 419 aa20.02■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.02■□□□□ 0.8
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ATP10DQ9P241 1426 aa20.02■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TSPYL6Q8N831 410 aa20.01■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.01■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GPTP24298 496 aa20■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 YY1P25490 414 aa20■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ST5P78524 1137 aa20■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.99■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MIER1Q8N108 512 aa19.99■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.99■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PIM2Q9P1W9 311 aa19.99■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.99■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.97■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.97■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HYPKQ9NX55 129 aa19.97■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 H0YIN7 160 aa19.96■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PDE6BP35913 854 aa19.96■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF521Q96K83 1311 aa19.96■□□□□ 0.79
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SUSD4Q5VX71 490 aa19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CACNA1FO60840 1977 aa19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ABCC12Q96J65 1359 aa19.95■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GOLGA2Q08379 1002 aa19.94■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NYXQ9GZU5 481 aa19.94■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLX4Q8IY92 1834 aa19.93■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.93■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.93■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.93■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NTSR2O95665 410 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms