RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC150Q8NCX0 1101 aa17.25■□□□□ 0.35
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.2■□□□□ 0.34
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTR9Q6PD62 1173 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF5BP33176 963 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF165P49910 485 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM67Q5HYA8 995 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BIN1O00499 593 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHDP01880 384 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC82Q8N4S0 544 aa17.17■□□□□ 0.34
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