RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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GPC1-202ENST00000420138 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.11■■□□□ 1.77
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GPC1-202ENST00000420138 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.97■■□□□ 1.75
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GPC1-202ENST00000420138 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
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GPC1-202ENST00000420138 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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GPC1-202ENST00000420138 HLFQ16534 295 aa25.89■■□□□ 1.74
GPC1-202ENST00000420138 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.89■■□□□ 1.74
GPC1-202ENST00000420138 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.89■■□□□ 1.74
GPC1-202ENST00000420138 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.89■■□□□ 1.74
GPC1-202ENST00000420138 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.89■■□□□ 1.74
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