RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 YY1P25490 414 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRNA5P30532 468 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 PIM2Q9P1W9 311 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 UTRNP46939 3433 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 BCS1LQ9Y276 419 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 NPHP1O15259 732 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 COPS6Q7L5N1 327 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR63Q8IWG1 891 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 CNBD1Q8NA66 436 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 IL16Q14005 1332 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 CCER2I3L3R5 266 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM177BA6PVY3 158 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP4-204ENST00000416021 H0YIN7 160 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE6BP35913 854 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 ST5P78524 1137 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN7AQ01118 1682 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPYL6Q8N831 410 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 HYPKQ9NX55 129 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 GPTP24298 496 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 SUSD4Q5VX71 490 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 NYXQ9GZU5 481 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL6Q8N841 843 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 BCORQ6W2J9 1755 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP10DQ9P241 1426 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA2Q08379 1002 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 TCIRG1Q13488 830 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP10Q53GL7 1025 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 SRGNP10124 158 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 ERFEQ4G0M1 354 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 MIER1Q8N108 512 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP4-204ENST00000416021 MASTLQ96GX5 879 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 STYK1Q6J9G0 422 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 NTSR2O95665 410 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP10Q86W26 655 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 CNKSR1Q969H4 720 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF521Q96K83 1311 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 VAMP4O75379 141 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 STK31Q9BXU1 1019 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 NPR1P16066 1061 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A2P04920 1241 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP98P52948 1817 aa27.13■■□□□ 1.93
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