RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.04■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 H0YIN7 160 aa31.04■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.04■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 CFAP44Q96MT7 982 aa31.04■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 PDIA6Q15084 440 aa31.03■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 MRS2Q9HD23 443 aa31.03■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 NPHP1O15259 732 aa31.02■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 PDE6BP35913 854 aa31.02■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 KRT24Q2M2I5 525 aa31.02■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.02■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.01■■■□□ 2.56
VSTM2A-202ENST00000402613 ST5P78524 1137 aa31.01■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.01■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa31.01■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF853P0CG23 659 aa30.99■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 TTLL6Q8N841 843 aa30.99■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 ADCY9O60503 1353 aa30.99■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 PROSER3Q2NL68 480 aa30.98■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.98■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 NECTIN2Q92692 538 aa30.98■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 MBIPQ9NS73 344 aa30.98■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.97■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 ANXA1P04083 346 aa30.96■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 IFT57Q9NWB7 429 aa30.96■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP10DQ9P241 1426 aa30.96■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM177BA6PVY3 158 aa30.94■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 HOXB7P09629 217 aa30.94■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 GNAI1P63096 354 aa30.94■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.93■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.93■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 SRGNP10124 158 aa30.91■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.91■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.91■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.9■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 COPS6Q7L5N1 327 aa30.9■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.9■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 GPTP24298 496 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC27Q2M243 656 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 STYK1Q6J9G0 422 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 NYXQ9GZU5 481 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.89■■■□□ 2.54
VSTM2A-202ENST00000402613 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.88■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 MASTLQ96GX5 879 aa30.88■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.88■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 CNKSR1Q969H4 720 aa30.87■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 SUSD4Q5VX71 490 aa30.86■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 WWC1Q8IX03 1113 aa30.86■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.85■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 NUP98P52948 1817 aa30.83■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 C21orf2O43822 256 aa30.83■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 NPR1P16066 1061 aa30.83■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 RASSF7Q02833 373 aa30.83■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 ERFEQ4G0M1 354 aa30.83■■■□□ 2.53
VSTM2A-202ENST00000402613 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 PARP10Q53GL7 1025 aa30.82■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.82■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 RNF181Q9P0P0 153 aa30.82■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC12Q96J65 1359 aa30.81■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 NTSR2O95665 410 aa30.8■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.8■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.8■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 HYPKQ9NX55 129 aa30.8■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 NFKBIEO00221 500 aa30.79■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 LMNB1P20700 586 aa30.78■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 PRELPP51888 382 aa30.78■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 C1QTNF8P60827 252 aa30.78■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 TCIRG1Q13488 830 aa30.78■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.78■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 CRY2Q49AN0 593 aa30.77■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.77■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.77■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
VSTM2A-202ENST00000402613 IL16Q14005 1332 aa30.75■■■□□ 2.51
VSTM2A-202ENST00000402613 NLRP10Q86W26 655 aa30.75■■■□□ 2.51
VSTM2A-202ENST00000402613 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.75■■■□□ 2.51
VSTM2A-202ENST00000402613 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
VSTM2A-202ENST00000402613 ALDH1B1P30837 517 aa30.74■■■□□ 2.51
VSTM2A-202ENST00000402613 SOGA3Q5TF21 947 aa30.74■■■□□ 2.51
VSTM2A-202ENST00000402613 TSPYL6Q8N831 410 aa30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms