RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 SLX4Q8IY92 1834 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRK-208ENST00000392449 HLFQ16534 295 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRK-208ENST00000392449 TOMM70O94826 608 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRK-208ENST00000392449 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRK-208ENST00000392449 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRK-208ENST00000392449 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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PTPRK-208ENST00000392449 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.73■■□□□ 1.07
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PTPRK-208ENST00000392449 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRK-208ENST00000392449 CHL1O00533 1208 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-208ENST00000392449 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-208ENST00000392449 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRK-208ENST00000392449 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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