RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 MARK1Q9P0L2 795 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.01□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 KLF15Q9UIH9 416 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 C21orf2O43822 256 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMPD1P23109 780 aa6□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 GPAT2Q6NUI2 795 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGB2P05107 769 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTK7Q13308 1070 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.99□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L10C9JJH3 530 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L12C9JPN9 530 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L11C9JVI0 530 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L21D6R901 530 aa5.98□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L22D6RA61 530 aa5.98□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L19D6RCP7 530 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP17L20D6RJB6 530 aa5.98□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 MDFIQ99750 246 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.98□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 COL8A1P27658 744 aa5.97□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 DPYDQ12882 1025 aa5.97□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.97□□□□□ -1.45
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RNU6-601P-201ENST00000384540 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIF1AQ16665 826 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SUSD3Q96L08 255 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 BRD7Q9NPI1 651 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRBA1A5PL33 1030 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSTNO14793 375 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 PROCP04070 461 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRIN2CQ14957 1233 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYT9Q86SS6 491 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOA3Q8NG57 546 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFRSF25Q93038 417 aa5.95□□□□□ -1.46
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RNU6-601P-201ENST00000384540 ARXQ96QS3 562 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC30A3Q99726 388 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPEM2Q0P670 501 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 RTN1Q16799 776 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 IER5Q5VY09 327 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 NEUROD1Q13562 356 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 HINFPQ9BQA5 517 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-601P-201ENST00000384540 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.92□□□□□ -1.46
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