RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 COL15A1P39059 1388 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 FLIIQ13045 1269 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 COPS6Q7L5N1 327 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-204ENST00000373436 PHF14O94880 888 aa25.39■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC15A2Q16348 729 aa25.39■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 STK32BQ9NY57 414 aa25.39■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 C4AP0C0L4 1744 aa25.39■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 SSFA2P28290 1259 aa25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ADRA2BP18089 450 aa25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ARXQ96QS3 562 aa25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 PTPRCP08575 1304 aa25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A087WZG4 1122 aa25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 BCORQ6W2J9 1755 aa25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1-204ENST00000373436 ADCY9O60503 1353 aa25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 RFC4P35249 363 aa25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 SCN7AQ01118 1682 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 NUP98P52948 1817 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 KSR2Q6VAB6 950 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 CAMTA2O94983 1202 aa25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 NARFQ9UHQ1 456 aa25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 F6X3S4 739 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 ZPR1O75312 459 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 AAMPQ13685 434 aa25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 HLFQ16534 295 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 ABCC4O15439 1325 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-204ENST00000373436 MSH5O43196 834 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 RGL2O15211 777 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 GYS1P13807 737 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 MYD88Q99836 296 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 TCIRG1Q13488 830 aa25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.2■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.2■■□□□ 1.63
RALGPS1-204ENST00000373436 CASZ1Q86V15 1759 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP10DQ9P241 1426 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 BEND3Q5T5X7 828 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.2■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 IGKV5-2P06315 115 aa25.18■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.18■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 IGHDP01880 384 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 GPTP24298 496 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 LINS1Q8NG48 757 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-204ENST00000373436 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms