RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.49■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 ISM2Q6H9L7 571 aa21.48■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.48■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 NF2P35240 595 aa21.48■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF20AO95235 890 aa21.48■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.47■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 SDSP20132 328 aa21.47■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 TUBB4AP04350 444 aa21.47■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 GOPCQ9HD26 462 aa21.47■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.47■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 UBASH3AP57075 661 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 DACT1Q9NYF0 836 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 MYZAPP0CAP1 466 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CTAGE8P0CG41 777 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.46■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 PTGS1P23219 599 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 AIDAQ96BJ3 306 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 JADE2Q9NQC1 790 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.45■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 BTBD11A6QL63 1104 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 SEC24BO95487 1268 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ATF3P18847 181 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC102BQ68D86 513 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPA4P34932 840 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS36Q86VN1 386 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 EVI5LQ96CN4 794 aa21.44■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 RASSF4Q9H2L5 321 aa21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 HSF2BPO75031 334 aa21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP2B2Q01814 1243 aa21.43■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 NECAB1Q8N987 351 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TYRO3Q06418 890 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CUL7Q14999 1698 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP2C2O75185 946 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 F13A1P00488 732 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ANAPC15P60006 121 aa21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP112Q8N8E3 955 aa21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPRCP08575 1304 aa21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA1Q92805 767 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 RBSNQ9H1K0 784 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 SYT1P21579 422 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 EBAG9O00559 213 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TSG101Q99816 390 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.4■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TERF1P54274 439 aa21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS18Q9P253 973 aa21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 USP16Q9Y5T5 823 aa21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.39■■□□□ 1.02
AMIGO1-202ENST00000369864 N4BP3O15049 544 aa21.39■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 CETN2P41208 172 aa21.39■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 NEK1Q96PY6 1258 aa21.39■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.39■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 CABP4P57796 275 aa21.38■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.38■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.38■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE4AQ14139 1066 aa21.38■■□□□ 1.01
AMIGO1-202ENST00000369864 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms