RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 CCDC7Q96M83 1385 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ATP10BO94823 1461 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 IQCA1Q86XH1 822 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 DACH1Q9UI36 760 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 STX6O43752 255 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 FERP16591 822 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ABI1Q8IZP0 508 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 MAP7D2Q96T17 732 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CTNNA3Q9UI47 895 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CETN1Q12798 172 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TMEM266Q2M3C6 531 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 FBXO41Q8TF61 875 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ZNF428Q96B54 188 aa4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SEC24BO95487 1268 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SIL1Q9H173 461 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SH2D4AQ9H788 454 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 MAP3K12Q12852 859 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 JMYQ8N9B5 988 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TSG101Q99816 390 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 PDE4AP27815 886 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ATP2B3Q16720 1220 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TMEM132EQ6IEE7 984 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ZNF592Q92610 1267 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 PANK3Q9H999 370 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 HOOK3Q86VS8 718 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 NBPF1Q3BBV0 1214 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 PHACTR2O75167 634 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CDKL5O76039 1030 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ACEP12821 1306 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 NDC80O14777 642 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CHRNA2Q15822 529 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 USP48Q86UV5 1035 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 WASF1Q92558 559 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 GNPATO15228 680 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RABEP1Q15276 862 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 NBPF15Q8N660 670 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 OSBPP22059 807 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CCDC89Q8N998 374 aa4.79□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 KIF14Q15058 1648 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 WDR7Q9Y4E6 1490 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CFAP58Q5T655 872 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SIRT1Q96EB6 747 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TNFAIP1Q13829 316 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RAB23Q9ULC3 237 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 KCNH4Q9UQ05 1017 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SNX16P57768 344 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RETREG2Q8NC44 543 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 SYNCQ9H7C4 482 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TRIM37O94972 964 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ZWINTO95229 277 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 VIMP08670 466 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 GPTP24298 496 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 TTC30AQ86WT1 665 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 FAM212AQ96EL1 285 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa4.78□□□□□ -1.64
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms