RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-202ENST00000334414 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-202ENST00000334414 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-202ENST00000334414 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-202ENST00000334414 ELP1O95163 1332 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRB-202ENST00000334414 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CEP120Q8N960 986 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC114Q96M63 670 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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PTPRB-202ENST00000334414 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
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PTPRB-202ENST00000334414 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRB-202ENST00000334414 A0A1W2PRG0 241 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF365Q70YC5 407 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RAI14Q9P0K7 980 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 UBE4AQ14139 1066 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PTPRCP08575 1304 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RAD21O60216 631 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TNNC1P63316 161 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PPP1R2P41236 205 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 NLRP5P59047 1200 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ERO1AQ96HE7 468 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 STX6O43752 255 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 FOSBP53539 338 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MTMR3Q13615 1198 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 GGT6Q6P531 493 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 STRN4Q9NRL3 753 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MAP2K2P36507 400 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 NAA25Q14CX7 972 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TMC6Q7Z403 805 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.31□□□□□ -1.4
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