RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 BCL11AQ9H165 835 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 SEC24BO95487 1268 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 STARD3NLO95772 234 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 HSPA1LP34931 641 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 GCKRQ14397 625 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.79■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 MTX1Q13505 466 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 USP21Q9UK80 565 aa23.78■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.76■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.76■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.76■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 SUCLG2Q96I99 432 aa23.76■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 KAZALD1Q96I82 304 aa23.75■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.74■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 A0A0G2JS52 829 aa23.74■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 RAB11FIP3O75154 756 aa23.73■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.72■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 TTC22Q5TAA0 569 aa23.71■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.71■■□□□ 1.39
UPP1-201ENST00000331803 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 A0A087WZG4 1122 aa23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 MSH5O43196 834 aa23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.69■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 MYT1Q01538 1121 aa23.69■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 PDE1AP54750 535 aa23.68■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.68■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.68■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.68■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.67■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.67■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 KCNQ2O43526 872 aa23.67■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.67■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 COL15A1P39059 1388 aa23.66■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.66■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.66■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.66■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 H7C1W4 665 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 CASP7P55210 303 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 TJP1Q07157 1748 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 MX1P20591 662 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 AFF2P51816 1311 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 SIK1P57059 783 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 TCIRG1Q13488 830 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
UPP1-201ENST00000331803 ATP6V1AP38606 617 aa23.64■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 ARXQ96QS3 562 aa23.64■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 PALLDQ8WX93 1383 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 CDC45O75419 566 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 STAP2Q9UGK3 403 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 SDSP20132 328 aa23.62■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.62■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.61■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.6■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.6■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 ITPK1Q13572 414 aa23.59■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.59■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 FOXO4P98177 505 aa23.58■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 HLFQ16534 295 aa23.58■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
UPP1-201ENST00000331803 AOX1Q06278 1338 aa23.58■■□□□ 1.36
UPP1-201ENST00000331803 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.57■■□□□ 1.36
UPP1-201ENST00000331803 ATRNO75882 1429 aa23.57■■□□□ 1.36
UPP1-201ENST00000331803 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms