RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-201ENST00000331789 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.08■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.08■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 ATG3Q9NT62 314 aa22.08■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 MX1P20591 662 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 STAP2Q9UGK3 403 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 LRP6O75581 1613 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 BCL9O00512 1426 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-201ENST00000331789 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.02■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 BECN1Q14457 450 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 SLIT2O94813 1529 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WZG4 1122 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 DDB1Q16531 1140 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 AOX1Q06278 1338 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 CASP7P55210 303 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 CASC1Q6TDU7 716 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 STARD3NLO95772 234 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 RILPL2Q969X0 211 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-201ENST00000331789 H7C1W4 665 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11e-23■□□□□ 10.8
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ACTB-201ENST00000331789 KIF2CQ99661 725 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 TJP1Q07157 1748 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 SASH1O94885 1247 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 BARGINQ6ZT62 677 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 SIL1Q9H173 461 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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ACTB-201ENST00000331789 NBR1Q14596 966 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 C8orf37Q96NL8 207 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 USP26Q9BXU7 913 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 COL15A1P39059 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 AK9Q5TCS8 1911 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JS52 829 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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ACTB-201ENST00000331789 ERC2O15083 957 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 CHMLP26374 656 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 FOXO4P98177 505 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 ARXQ96QS3 562 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 TCIRG1Q13488 830 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 AACSQ86V21 672 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 COPRSQ9NQ92 184 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-201ENST00000331789 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.89■■□□□ 1.09
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