RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.86■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 PANK1Q8TE04 598 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 FLIIQ13045 1269 aa22.83■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.83■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.82■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 COG6Q9Y2V7 657 aa22.82■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 USP16Q9Y5T5 823 aa22.82■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC4O15439 1325 aa22.82■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 NECTIN2Q92692 538 aa22.81■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.81■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 STARD3NLO95772 234 aa22.79■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 RLBP1P12271 317 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 PDIA6Q15084 440 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 GPR162Q16538 588 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-201ENST00000324444 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 RPS6KA4O75676 772 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 PROSER3Q2NL68 480 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 G2E3Q7L622 706 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 TNNQ9UQP3 1299 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF26B4DH59 902 aa22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 ADRA2BP18089 450 aa22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF15Q8N660 670 aa22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 A1BGP04217 495 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 KSR2Q6VAB6 950 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 ANXA1P04083 346 aa22.71■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 RFC4P35249 363 aa22.71■■□□□ 1.23
SYNE4-201ENST00000324444 MMP10P09238 476 aa22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 CHD4Q14839 1912 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 MYL6BP14649 208 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 GYS1P13807 737 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ATP10DQ9P241 1426 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 C4AP0C0L4 1744 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 GNAI3P08754 354 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 COPS6Q7L5N1 327 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 F6X3S4 739 aa22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH1L1O75891 902 aa22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.64■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.64■■□□□ 1.22
SYNE4-201ENST00000324444 BCORQ6W2J9 1755 aa22.64■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 ADCY9O60503 1353 aa22.64■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 GRIN3BO60391 1043 aa22.63■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 LINS1Q8NG48 757 aa22.63■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 BEND3Q5T5X7 828 aa22.62■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.62■■□□□ 1.21
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