RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.53■■□□□ 1.84
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SPHK1-201ENST00000323374 KAZALD1Q96I82 304 aa26.53■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 MYD88Q99836 296 aa26.52■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.52■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 GCKRQ14397 625 aa26.51■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 CNTROBQ8N137 903 aa26.51■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
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SPHK1-201ENST00000323374 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.5■■□□□ 1.83
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SPHK1-201ENST00000323374 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.49■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 ANAPC15P60006 121 aa26.49■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 GPATCH3Q96I76 525 aa26.48■■□□□ 1.83
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SPHK1-201ENST00000323374 GBP4Q96PP9 640 aa26.48■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.47■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 ABCA3Q99758 1704 aa26.46■■□□□ 1.83
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SPHK1-201ENST00000323374 EVA1CP58658 441 aa26.45■■□□□ 1.83
SPHK1-201ENST00000323374 STRN4Q9NRL3 753 aa26.45■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 GLI3P10071 1580 aa26.45■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 IL17RAQ96F46 866 aa26.44■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.44■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 NEK4P51957 841 aa26.44■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 AACSQ86V21 672 aa26.44■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 AK9Q5TCS8 1911 aa26.43■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 TRAK2O60296 914 aa26.43■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 MCM2P49736 904 aa26.43■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.43■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 PALD1Q9ULE6 856 aa26.43■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 SGSM2O43147 1006 aa26.42■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 SASH1O94885 1247 aa26.42■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 IL25Q9H293 177 aa26.42■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.41■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 NUCB2P80303 420 aa26.4■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.4■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 PTMSP20962 102 aa26.39■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 HSPA4P34932 840 aa26.39■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 COL15A1P39059 1388 aa26.39■■□□□ 1.82
SPHK1-201ENST00000323374 SSFA2P28290 1259 aa26.39■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 SIL1Q9H173 461 aa26.39■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF26B4DH59 902 aa26.38■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF14Q5TI25 921 aa26.38■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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SPHK1-201ENST00000323374 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.37■■□□□ 1.81
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SPHK1-201ENST00000323374 EVI5LQ96CN4 794 aa26.37■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.37■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.37■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 A0A087WZG4 1122 aa26.36■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.36■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 COPRSQ9NQ92 184 aa26.36■■□□□ 1.81
SPHK1-201ENST00000323374 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
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SPHK1-201ENST00000323374 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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SPHK1-201ENST00000323374 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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SPHK1-201ENST00000323374 CASP7P55210 303 aa26.32■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.32■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.31■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 HIP1O00291 1037 aa26.3■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 CUL4AQ13619 759 aa26.3■■□□□ 1.8
SPHK1-201ENST00000323374 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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