RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APBB1O00213 710 aa27.08■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB11FIP3O75154 756 aa27.08■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A1BGP04217 495 aa27.08■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS72Q15906 364 aa27.08■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC22Q5TAA0 569 aa27.07■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.07■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL15A1P39059 1388 aa27.07■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.07■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.06■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NGLY1Q96IV0 654 aa27.06■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TJP1Q07157 1748 aa27.06■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.05■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C8orf37Q96NL8 207 aa27.05■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.05■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STARD3NLO95772 234 aa27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KAZALD1Q96I82 304 aa27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUCLG2Q96I99 432 aa27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.02■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.02■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE1AP54750 535 aa27■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A9Q96Q91 983 aa27■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.99■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC45O75419 566 aa26.99■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.98■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAP2Q9UGK3 403 aa26.98■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.97■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AOX1Q06278 1338 aa26.97■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MX1P20591 662 aa26.97■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP7P55210 303 aa26.97■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.97■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.96■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.95■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RREB1Q92766 1687 aa26.95■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087WZG4 1122 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H7C1W4 665 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL11AQ9H165 835 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP21Q9UK80 565 aa26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SDSP20132 328 aa26.93■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPA1LP34931 641 aa26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCIRG1Q13488 830 aa26.9■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.89■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPRSQ9NQ92 184 aa26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP98P52948 1817 aa26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PALLDQ8WX93 1383 aa26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIK1P57059 783 aa26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASC1Q6TDU7 716 aa26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.893e-6■■■■□ 22.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AK9Q5TCS8 1911 aa26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXO4P98177 505 aa26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms