RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.05■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 NFKBIEO00221 500 aa30.04■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 RRAGCQ9HB90 399 aa30.04■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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CLTB-201ENST00000310418 C21orf2O43822 256 aa30.02■■■□□ 2.4
CLTB-201ENST00000310418 RALBP1Q15311 655 aa30.02■■■□□ 2.4
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CLTB-201ENST00000310418 CNKSR1Q969H4 720 aa30.01■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 SRGNP10124 158 aa30■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 APLP1P51693 650 aa30■■■□□ 2.39
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CLTB-201ENST00000310418 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
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CLTB-201ENST00000310418 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.99■■■□□ 2.39
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CLTB-201ENST00000310418 HLFQ16534 295 aa29.97■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.97■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.97■■■□□ 2.39
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CLTB-201ENST00000310418 SLX4Q8IY92 1834 aa29.96■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 CACNA1SQ13698 1873 aa29.95■■■□□ 2.39
CLTB-201ENST00000310418 FSTL1Q12841 308 aa29.95■■■□□ 2.39
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CLTB-201ENST00000310418 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.95■■■□□ 2.38
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CLTB-201ENST00000310418 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
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CLTB-201ENST00000310418 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.93■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 RIPK4P57078 832 aa29.92■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 SOGA3Q5TF21 947 aa29.92■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.91■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 NPR1P16066 1061 aa29.91■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 ERFEQ4G0M1 354 aa29.91■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.91■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 MYL6BP14649 208 aa29.9■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.9■■■□□ 2.38
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CLTB-201ENST00000310418 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.89■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.89■■■□□ 2.38
CLTB-201ENST00000310418 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.88■■■□□ 2.37
CLTB-201ENST00000310418 WDR90Q96KV7 1748 aa29.88■■■□□ 2.37
CLTB-201ENST00000310418 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
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CLTB-201ENST00000310418 NUP98P52948 1817 aa29.87■■■□□ 2.37
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CLTB-201ENST00000310418 ERBB4Q15303 1308 aa29.85■■■□□ 2.37
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CLTB-201ENST00000310418 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.84■■■□□ 2.37
CLTB-201ENST00000310418 POTECB2RU33 542 aa29.82■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.82■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.82■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 ABCC12Q96J65 1359 aa29.81■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 GPTP24298 496 aa29.81■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 ALDH1B1P30837 517 aa29.81■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 HTRA3P83110 453 aa29.81■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.8■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 NEUROD2Q15784 382 aa29.79■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 OLFM4Q6UX06 510 aa29.79■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
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CLTB-201ENST00000310418 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 PDIA6Q15084 440 aa29.78■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 CRY2Q49AN0 593 aa29.78■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.78■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 SUSD4Q5VX71 490 aa29.77■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.77■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.77■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 RUNDC1Q96C34 613 aa29.77■■■□□ 2.36
CLTB-201ENST00000310418 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.76■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 PROSER3Q2NL68 480 aa29.75■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
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CLTB-201ENST00000310418 KLRG1Q96E93 195 aa29.74■■■□□ 2.35
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CLTB-201ENST00000310418 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 PARP10Q53GL7 1025 aa29.72■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.72■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 NECTIN2Q92692 538 aa29.72■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.72■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.72■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 CHL1O00533 1208 aa29.71■■■□□ 2.35
CLTB-201ENST00000310418 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
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