RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.09■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 MX1P20591 662 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB4P16144 1822 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 BCL9O00512 1426 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 SLIT2O94813 1529 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 LRP6O75581 1613 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 DDB1Q16531 1140 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 STAP2Q9UGK3 403 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
VSTM4-201ENST00000298454 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.01■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WZG4 1122 aa28■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 BECN1Q14457 450 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.98■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 STARD3NLO95772 234 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 CASP7P55210 303 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 CASC1Q6TDU7 716 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM4-201ENST00000298454 AOX1Q06278 1338 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 BARGINQ6ZT62 677 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf37Q96NL8 207 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 JCADQ9P266 1359 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 RILPL2Q969X0 211 aa27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 NGLY1Q96IV0 654 aa27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 SIL1Q9H173 461 aa27.93■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 COL15A1P39059 1388 aa27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JS52 829 aa27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 H7C1W4 665 aa27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 SASH1O94885 1247 aa27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 KIF2CQ99661 725 aa27.92■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.9■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.89■■■□□ 2.06
VSTM4-201ENST00000298454 NBR1Q14596 966 aa27.89■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 USP26Q9BXU7 913 aa27.89■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 ARXQ96QS3 562 aa27.88■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.87■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 FOXO4P98177 505 aa27.87■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 TCIRG1Q13488 830 aa27.87■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.87■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.87■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 TJP1Q07157 1748 aa27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 ERC2O15083 957 aa27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 AACSQ86V21 672 aa27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 COPRSQ9NQ92 184 aa27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms