RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 A0A0G2JS52 829 aa26.47■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.47■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.47■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.47■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.45■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.45■■□□□ 1.83
SOX17-201ENST00000297316 GRM8O00222 908 aa26.45■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 HSPA1LP34931 641 aa26.45■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 BARGINQ6ZT62 677 aa26.45■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 SSH3Q8TE77 659 aa26.45■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 SRGAP3O43295 1099 aa26.44■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.44■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.44■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 ERBB4Q15303 1308 aa26.44■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.43■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 KAZALD1Q96I82 304 aa26.43■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 SUCLG2Q96I99 432 aa26.43■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 POLA2Q14181 598 aa26.42■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 TTC22Q5TAA0 569 aa26.42■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.42■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.42■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 GCKRQ14397 625 aa26.41■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 VPS72Q15906 364 aa26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 UTYO14607 1347 aa26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.4■■□□□ 1.82
SOX17-201ENST00000297316 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.39■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.38■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 USP21Q9UK80 565 aa26.38■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 KCNQ2O43526 872 aa26.36■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.36■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.36■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.36■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 MTX1Q13505 466 aa26.35■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 CDC45O75419 566 aa26.34■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 TJP1Q07157 1748 aa26.34■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 STARD3NLO95772 234 aa26.34■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.34■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.34■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SOX17-201ENST00000297316 SDSP20132 328 aa26.32■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 A0A087WZG4 1122 aa26.32■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 PDE1AP54750 535 aa26.32■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.32■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 ARXQ96QS3 562 aa26.31■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.31■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.3■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.3■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 BECN1Q14457 450 aa26.29■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.29■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 FAM182BQ5T319 152 aa26.28■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.28■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 CASP7P55210 303 aa26.28■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.28■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.28■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 RAB11FIP3O75154 756 aa26.27■■□□□ 1.8
SOX17-201ENST00000297316 AFF2P51816 1311 aa26.26■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 MX1P20591 662 aa26.26■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 ATP6V1AP38606 617 aa26.25■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.25■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 KIF2CQ99661 725 aa26.25■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 SIL1Q9H173 461 aa26.25■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.24■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 SIK1P57059 783 aa26.24■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 ITPK1Q13572 414 aa26.24■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 HLFQ16534 295 aa26.24■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.24■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 H7C1W4 665 aa26.23■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.23■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 PALLDQ8WX93 1383 aa26.23■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.23■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 TCIRG1Q13488 830 aa26.22■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.22■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.21■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.21■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.21■■□□□ 1.79
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms