RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296122.10

PPP1CB-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CB, Length 3,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-201ENST00000296122 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 SLC4A3P48751 1232 aa16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 SUCLG2Q96I99 432 aa16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 COL18A1P39060 1754 aa16.11■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.1■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 CACNA1FO60840 1977 aa16.1■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 USP21Q9UK80 565 aa16.1■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 AACSQ86V21 672 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 MSH5O43196 834 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 CNTROBQ8N137 903 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 ATG3Q9NT62 314 aa16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 ATP6V1AP38606 617 aa16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 CERKQ8TCT0 537 aa16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.08■□□□□ 0.17
PPP1CB-201ENST00000296122 SDSP20132 328 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NBR1Q14596 966 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 IGKV5-2P06315 115 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 POLA2Q14181 598 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NBPF26B4DH59 902 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 GORABQ5T7V8 394 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NBPF14Q5TI25 921 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NBPF15Q8N660 670 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NPHP1O15259 732 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 GPTP24298 496 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 PHLPP1O60346 1717 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 MTX1Q13505 466 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 BARGINQ6ZT62 677 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 KCNJ4P48050 445 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 TCIRG1Q13488 830 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 MRC1P22897 1456 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 VPS72Q15906 364 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 TNS2Q63HR2 1409 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM177BA6PVY3 158 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PPP1CB-201ENST00000296122 AOX1Q06278 1338 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.02■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 SIK1P57059 783 aa16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 ST18O60284 1047 aa16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 UTYO14607 1347 aa15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 STAP2Q9UGK3 403 aa15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 HIP1O00291 1037 aa15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 FSD1Q9BTV5 496 aa15.99■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 BCL9O00512 1426 aa15.98■□□□□ 0.15
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM89AQ96GI7 184 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms