RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 POTEJP0CG39 1038 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 YEATS4O95619 227 aa24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH4A6NGS2 130 aa24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 NEK1Q96PY6 1258 aa24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 USP16Q9Y5T5 823 aa24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 SHTN1A0MZ66 631 aa24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 PAFAH1B1P43034 410 aa24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 TNIP1Q15025 636 aa24.45■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 POTEB2H3BUK9 544 aa24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMX3Q96JJ7 454 aa24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC15P60006 121 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 KANK3Q6NY19 840 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 GOLIM4O00461 696 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP5P59047 1200 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMC6Q7Z403 805 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 LUZP1Q86V48 1076 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CBX1P83916 185 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 SDSP20132 328 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC102BQ68D86 513 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 NCOA7Q8NI08 942 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZPR1O75312 459 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83GA6ND36 823 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 SNX21Q969T3 373 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN2AQ12879 1464 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 BIN1O00499 593 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.54e-9■■■■■ 32.8
CCSAP-201ENST00000284617 AMPD3Q01432 767 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 FOXO3O43524 673 aa24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 KIF5BP33176 963 aa24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 SLF2Q8IX21 1173 aa24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC1I1O14576 645 aa24.39■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.39■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 PDE1AP54750 535 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.38■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 INCENPQ9NQS7 918 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 MEIS3Q99687 375 aa24.36■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.36■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.36■■□□□ 1.49
CCSAP-201ENST00000284617 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms