RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
UBASH3B-201ENST00000284273 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
UBASH3B-201ENST00000284273 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
UBASH3B-201ENST00000284273 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.77□□□□□ -0.2
UBASH3B-201ENST00000284273 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNCQ9H7C4 482 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC102AQ96A19 550 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC2Q9BYS8 371 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.77□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 C8orf76Q96K31 380 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 GRIN2BQ13224 1484 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 TAF12Q16514 161 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF14Q5TI25 921 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM170AA1A519 330 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 BAG3O95817 575 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MX1P20591 662 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NF2P35240 595 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 TMCO5BA8MYB1 307 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SPA17Q15506 151 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP45Q9UL16 551 aa13.75□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 FKBP15Q5T1M5 1219 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP7A1P22680 504 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CBFA2T2O43439 604 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 DDB1Q16531 1140 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MSL1Q68DK7 614 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CD109Q6YHK3 1445 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 JDP2Q8WYK2 163 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF21BO75037 1637 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 PHACTR2O75167 634 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MCM2P49736 904 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 GINS2Q9Y248 185 aa13.74□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MSH6P52701 1360 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 ERICH4A6NGS2 130 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 IFNL2Q8IZJ0 200 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SIRT1Q96EB6 747 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 TCHPQ9BT92 498 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.73□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SYCE3A1L190 88 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CETN2P41208 172 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE4BQ07343 736 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC184Q52MB2 194 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CCP110O43303 1012 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SORBS3O60504 671 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 FCHSD2O94868 740 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF6P56537 245 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGEF11O15085 1522 aa13.72□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 KRT32Q14532 448 aa13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CALML4Q96GE6 196 aa13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CNNM3Q8NE01 707 aa13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR162Q16538 588 aa13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MBD3O95983 291 aa13.71□□□□□ -0.21
UBASH3B-201ENST00000284273 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms