RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272139.4

C1orf35-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf35, Length 1,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-201ENST00000272139 COPS6Q7L5N1 327 aa29.32■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 NARFQ9UHQ1 456 aa29.31■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.3■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.27■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.27■■■□□ 2.28
C1orf35-201ENST00000272139 G2E3Q7L622 706 aa29.26■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 CAMTA2O94983 1202 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 NUP98P52948 1817 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 FLIIQ13045 1269 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 GYS1P13807 737 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 BCORQ6W2J9 1755 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 SCN7AQ01118 1682 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
C1orf35-201ENST00000272139 RGL2O15211 777 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 FKBP8Q14318 412 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.2■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 UTRNP46939 3433 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 BCAR3O75815 825 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 HLFQ16534 295 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 MMP10P09238 476 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 GPR162Q16538 588 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 KSR2Q6VAB6 950 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.17■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 PTPRCP08575 1304 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 YY1P25490 414 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 KIF16BQ96L93 1317 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf35-201ENST00000272139 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.13■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.13■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 TCIRG1Q13488 830 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 SETDB2Q96T68 719 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 TM4SF1P30408 202 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 NFIXQ14938 502 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 ADCY9O60503 1353 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 PARP3Q9Y6F1 533 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.1■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 F6X3S4 739 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 GPTP24298 496 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 MYD88Q99836 296 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 ATP10DQ9P241 1426 aa29.08■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
C1orf35-201ENST00000272139 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 GRIN3BO60391 1043 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.05■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.05■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.05■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 DDR1Q08345 913 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 PARP10Q53GL7 1025 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 SERPINB2P05120 415 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 FAM177BA6PVY3 158 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 TGFB2P61812 414 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.02■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 CHD4Q14839 1912 aa29.02■■■□□ 2.24
C1orf35-201ENST00000272139 NPHP1O15259 732 aa29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms