RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HYPKQ9NX55 129 aa28.03■■■□□ 2.08
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SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 COPS6Q7L5N1 327 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 TM4SF1P30408 202 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 DDR1Q08345 913 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 NFIXQ14938 502 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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SLC25A39-201ENST00000225308 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC25A39-201ENST00000225308 ERVV-1B6SEH8 477 aa28■■■□□ 2.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28■■■□□ 2.07
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28■■■□□ 2.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 STK31Q9BXU1 1019 aa27.99■■■□□ 2.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.97■■■□□ 2.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC25A39-201ENST00000225308 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 SETDB2Q96T68 719 aa27.93■■■□□ 2.06
SLC25A39-201ENST00000225308 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.93■■■□□ 2.06
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.92■■■□□ 2.06
SLC25A39-201ENST00000225308 G2E3Q7L622 706 aa27.92■■■□□ 2.06
SLC25A39-201ENST00000225308 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
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SLC25A39-201ENST00000225308 SYT17Q9BSW7 474 aa27.91■■■□□ 2.06
SLC25A39-201ENST00000225308 KLHL34Q8N239 644 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A39-201ENST00000225308 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.89■■■□□ 2.06
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SLC25A39-201ENST00000225308 NYXQ9GZU5 481 aa27.78■■■□□ 2.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 TGFB2P61812 414 aa27.77■■■□□ 2.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 ST5P78524 1137 aa27.76■■■□□ 2.03
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