RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wdr63B2RY71 923 aa30.2■■■□□ 2.43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mcmdc2E9Q956 681 aa30.2■■■□□ 2.43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ly75Q60767 1723 aa30.19■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 InsrrQ9WTL4 1300 aa30.17■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa30.17■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Bicdl1A0JNT9 577 aa30.16■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 AbraQ8BUZ1 375 aa30.16■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myd88P22366 296 aa30.16■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ak7Q9D2H2 614 aa30.15■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cwc25Q9DBF7 416 aa30.15■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ehd4Q9EQP2 541 aa30.14■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 C4bP01029 1738 aa30.14■■■□□ 2.42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prr5lA2AVJ5 370 aa30.13■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lama4P97927 1816 aa30.13■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mcm2P97310 904 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 GpkowQ56A08 488 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adora1Q60612 326 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stard3nlQ9DCI3 235 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap33Q80YF9 1305 aa30.12■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Casz1Q9CWL2 1761 aa30.11■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ubap1lG3UW59 384 aa30.11■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc4E9Q236 1325 aa30.1■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gnat3Q3V3I2 354 aa30.1■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Jarid2Q62315 1234 aa30.1■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa30.1■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 VgfQ0VGU4 617 aa30.09■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Bcar3Q9QZK2 820 aa30.08■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa30.08■■■□□ 2.41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zbtb3Q91X45 518 aa30.07■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Strn4P58404 760 aa30.06■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam213aQ9CYH2 218 aa30.06■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Smarcc1P97496 1104 aa30.06■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ipo8Q7TMY7 1010 aa30.06■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Greb1lB9EJV3 1913 aa30.05■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm13023A2A8N2 498 aa30.05■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ets1P27577 440 aa30.04■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cyp19a1P28649 503 aa30.04■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igflr1Q3U4N7 345 aa30.03■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q8BT18 775 aa30.03■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trip6Q9Z1Y4 480 aa30.03■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Esco1Q69Z69 843 aa30.03■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fbxo41Q6NS60 873 aa30.02■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Clca2Q8BG22 942 aa30.02■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myh1Q5SX40 1942 aa30.01■■■□□ 2.4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa30■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ttc19Q8CC21 365 aa30■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cct4P80315 539 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa30■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nek4Q9Z1J2 792 aa30■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 GalcP54818 684 aa29.99■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa29.99■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slf2Q6P9P0 1278 aa29.99■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sugp2Q8CH09 1067 aa29.99■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 AtrnQ9WU60 1428 aa29.98■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem87bQ8BKU8 555 aa29.98■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 GptQ8QZR5 496 aa29.98■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 CanxP35564 591 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nkx1-2P42580 305 aa29.96■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dhx38Q80X98 1228 aa29.96■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa29.96■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 CenppQ9CZ92 286 aa29.96■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plch1Q4KWH5 1682 aa29.95■■■□□ 2.39
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hmox1P14901 289 aa29.94■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 CalcaP70160 136 aa29.94■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 NexnQ7TPW1 607 aa29.94■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 LratQ9JI60 231 aa29.94■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prr29B1ARI9 187 aa29.93■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa29.93■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zkscan2G3X952 960 aa29.92■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Snai1Q02085 264 aa29.92■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmc1Q8R4P5 757 aa29.92■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q8C5K5 320 aa29.92■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prl3d2F6R3P9 224 aa29.91■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Smc4Q8CG47 1286 aa29.91■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 RestQ8VIG1 1082 aa29.91■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Foxo4Q9WVH3 505 aa29.91■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa29.9■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cops6O88545 324 aa29.9■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 BcanQ61361 883 aa29.9■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 SowahdQ8BY98 327 aa29.9■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp1b3P97370 278 aa29.9■■■□□ 2.38
Odc1-201ENSMUST00000171737 Susd4Q8BH32 490 aa29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms