RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000014640.8

Ankrd28-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd28, Length 6,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atf7Q8R0S1 413 aa27.08■■□□□ 1.93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hs2st1Q8R3H7 356 aa27.08■■□□□ 1.93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slx4Q6P1D7 1565 aa27.08■■□□□ 1.93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 ImpactO55091 318 aa27.08■■□□□ 1.93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppfia3P60469 1194 aa27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Znf771Q8BJ90 317 aa27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slc1a4O35874 532 aa27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cnga2Q62398 664 aa27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Bin1O08539 588 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cfap53Q9D439 514 aa27.06■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa27.06■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ankrd44B2RXR6 993 aa27.06■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Igflr1Q3U4N7 345 aa27.06■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc191J3QQ27 883 aa27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Homer1Q9Z2Y3 366 aa27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kmt5bQ3U8K7 883 aa27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stx6Q9JKK1 255 aa27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tmx4Q8C0L0 335 aa27.05■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fam170aQ66LM6 333 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 PaskQ8CEE6 1383 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tax1bp1Q3UKC1 814 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Znf428Q8C1M2 176 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fermt2Q8CIB5 680 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hmg20bQ9Z104 317 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zscan29E9Q5B4 869 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Amotl2Q8K371 772 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Igbp1bQ9QZ29 343 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kifc2O08672 792 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tmem266Q8BZB3 538 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stx1aO35526 288 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zranb1Q7M760 708 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Krt25Q8VCW2 446 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kdm5bQ80Y84 1544 aa27.02■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 DlatQ8BMF4 642 aa27.02■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Taf7Q9R1C0 341 aa27.02■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa27.02■■□□□ 1.92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Larp6Q8BN59 492 aa27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ncoa1P70365 1447 aa27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 WtapQ9ER69 396 aa27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Emilin2Q8K482 1074 aa27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Klhl10Q9D5V2 608 aa27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slc4a4O88343 1079 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stat1P42225 749 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pde1cQ64338 706 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Krt23Q99PS0 422 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zfp42P22227 288 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Calml4Q91WQ9 153 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Vps16Q920Q4 839 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp7aQ64430 1491 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Map2k1P31938 393 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ctnna2Q61301 953 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Wdr63B2RY71 923 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ano2Q8CFW1 1002 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 MthfsQ9D110 203 aa26.99■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Letm1Q9Z2I0 738 aa26.99■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cyp2ab1S4R196 498 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cnot6lQ8VEG6 555 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sil1Q9EPK6 465 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Dapk3O54784 448 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hoxb7P09024 217 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Uri1Q3TLD5 531 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Dydc2Q9D3X8 139 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rcan3Q9JKK0 239 aa26.98■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 DymQ8CHY3 669 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Jdp2P97875 163 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp2b1G5E829 1220 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cers3Q1A3B0 383 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ankrd1Q9CR42 319 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kif21aQ9QXL2 1672 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 GckrQ91X44 587 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nsrp1Q5NCR9 542 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm21985Q6P6P5 1106 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fam160b2Q80YR2 744 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ano8Q6PB70 1060 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rasa1E9PYG6 1038 aa26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.8 ms