RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 CPMP14384 443 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ALDH9A1P49189 494 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ERVK-8P63133 956 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RNF4P78317 190 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DUSP2Q05923 314 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR1C1Q15619 314 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CHI3L2Q15782 390 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SPINK14Q6IE38 97 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR8K3Q8NH51 312 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RIT1Q92963 219 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF681Q96N22 645 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TMEM120BA0PK00 339 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FCHO1O14526 889 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PIP5K1BO14986 540 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 RGS14O43566 566 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DYRK3O43781 588 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SEC22BO75396 215 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 OR2J2O76002 312 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-206ENST00000443528 SERPINE1P05121 402 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 DRD2P14416 443 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SOX18P35713 384 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-206ENST00000443528 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ZNF766Q5HY98 468 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 KLHL29Q96CT2 875 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 ART5Q96L15 291 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 TAAR6Q96RI8 345 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-206ENST00000443528 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 C1orf109Q9NX04 203 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 LRFN1Q9P244 771 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MAP10Q9P2G4 905 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 MYOTQ9UBF9 498 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 PSME2Q9UL46 239 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-206ENST00000443528 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 WWP2O00308 870 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ATP1B1P05026 303 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NEFHP12036 1026 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 S1PR1P21453 382 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 BGNP21810 368 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TACR1P25103 407 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GSTM5P46439 218 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CYB561P49447 251 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC37A1P57057 533 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MGAT2Q10469 447 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NR6A1Q15406 480 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HOMEZQ8IX15 550 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 DDIASQ8IXT1 998 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GRHL3Q8TE85 626 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ARL8AQ96BM9 186 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SCMH1Q96GD3 660 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EGLN2Q96KS0 407 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FCRL1Q96LA6 429 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C3orf30Q96M34 536 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MYNNQ9NPC7 610 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.58□□□□□ -0.08
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