RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PRG0 241 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAGE4O60829 102 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADD2P35612 726 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAPPC10P48553 1259 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTTPP55157 894 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACTR2P61160 394 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIMM10P62072 90 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TLE2Q04725 743 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF616Q08AN1 781 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 STARD3Q14849 445 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR45BQ5MNZ6 344 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4A47Q6IF82 309 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARSKQ6UWY0 536 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAMD12Q8N8I0 201 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG16L2Q8NAA4 619 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSMEM1Q8WWF3 244 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL21AQ8WXB1 218 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPS2Q9BXY5 557 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZMYND12Q9H0C1 365 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZHX3Q9H4I2 956 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCH5Q9NX47 278 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDAP2Q9NXN4 497 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMACRQ9UHK6 382 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR83OSQ9Y284 106 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDHAF1A6NFY7 115 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC36A6NLP5 189 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HCRTR2O43614 444 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED24O75448 989 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMG1P04279 462 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST1H2ABP04908 130 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD59P13987 128 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST1H2ADP20671 130 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFTPDP35247 375 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOC2AQ14183 400 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GGT6Q6P531 493 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FIGLAQ6QHK4 219 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC22A25Q6T423 547 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL14Q8N4G2 192 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIPHQ8WWY8 451 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAF4BQ92750 862 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FNDC11Q9BVV2 318 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUT8Q9BYC5 575 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 NT5DC2Q9H857 520 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXL5Q9UKA1 691 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 NME7Q9Y5B8 376 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC17A2O00624 439 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIP5K1CO60331 668 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FSTL3O95633 263 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBX18O95935 607 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 CT45A10P0DMU9 189 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLULP15104 373 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 IDSP22304 550 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV1-2P23083 117 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGT1A3P35503 534 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALDH3A2P51648 485 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPCMLQ14982 345 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD55Q3KP44 614 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM219BQ5XKK7 198 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf63Q6NUN7 778 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYB5D1Q6P9G0 228 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDPD3Q7L5L3 318 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF573Q86YE8 665 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC5CLQ8IV45 518 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 GATSQ8NAP1 163 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTBD9Q96Q07 612 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2M2Q96R28 347 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF607Q96SK3 696 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 NMUR1Q9HB89 426 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 NGBQ9NPG2 151 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAG1Q9NWQ8 432 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS6KA6Q9UK32 745 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSD2O96028 1365 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 THSD7BQ9C0I4 1608 aa-1.66□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms