RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SNX24Q9Y343 169 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 PDE9AO76083 593 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SUN1O94901 812 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SP1P08047 785 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 GSTA2P09210 222 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 COX6A1P12074 109 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ITGAXP20702 1163 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CDH3P22223 829 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ACVR2AP27037 513 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SERPINA4P29622 427 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 HSD17B3P37058 310 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 NSG1P42857 185 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ASCL1P50553 236 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CLCNKAP51800 687 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ARL4CP56559 192 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 WASHC5Q12768 1159 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TUBA3CQ13748 450 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CYTH1Q15438 398 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TRADDQ15628 312 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 PARP6Q2NL67 630 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 NXNQ6DKJ4 435 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SPINK14Q6IE38 97 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CYS1Q717R9 158 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CENPUQ71F23 418 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CALML6Q8TD86 181 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SMPDL3BQ92485 455 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 KIAA1191Q96A73 305 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 AP2M1Q96CW1 435 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF599Q96NL3 588 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 MAGEH1Q9H213 219 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ABCG8Q9H221 673 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 GBA3Q9H227 469 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 WDR54Q9H977 334 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 NFS1Q9Y697 457 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 COL7A1Q02388 2944 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 OR6C74A6NCV1 312 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 H3BMH7 237 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 MATN3O15232 486 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 PSMD3O43242 534 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 RIPK2O43353 540 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 HCRTR1O43613 425 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 OR2B3O76000 313 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TTC4O95801 387 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 IFNB1P01574 187 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 PAX1P15863 534 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ST6GAL1P15907 406 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TFEBP19484 476 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 PTPN3P26045 913 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 RFC3P40938 356 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 RGRP47804 291 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 MTNR1BP49286 362 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CASP9P55211 416 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 OR1C1Q15619 314 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TEX44Q53QW1 395 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 RTL6Q6ICC9 239 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CNSTQ6PJW8 725 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDMT1-210ENST00000488990 OOSP2Q86WS3 158 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms