RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB119Q8N690 84 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 DTX3Q8N9I9 347 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 RGMAQ96B86 450 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SPTBP11277 2137 aa11.99□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PQU0 124 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 AREL1O15033 823 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CBFA2T3O75081 653 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 GADD45AP24522 165 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TPTEP56180 551 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SNX11Q9Y5W9 270 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TMCC2O75069 709 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CXCL10P02778 98 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CTSEP14091 401 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 NPPBP16860 134 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 RXRGP48443 463 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CENPAP49450 140 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM107Q6UX40 140 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 L3MBTL4Q8NA19 623 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 8.7
UBXN4-201ENST00000272638 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 HERVK_113Q902F9 699 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CKAP5Q14008 2032 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TLR4O00206 839 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ATP6V1G1O75348 118 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 HPRP00739 348 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TYRP1P17643 537 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 MMP12P39900 470 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TMBIM6P55061 237 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TMC8Q8IU68 726 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 HOMEZQ8IX15 550 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CHFRQ96EP1 664 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 FCRL4Q96PJ5 515 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 MBOAT4Q96T53 435 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ITPAQ9BY32 194 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 OR51E2Q9H255 320 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SIP14410 1827 aa11.98□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 C7P10643 843 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PRLHRP49683 370 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TGM3Q08188 693 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 MAP4K2Q12851 820 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SLAMF1Q13291 335 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB134Q4QY38 66 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF675Q8TD23 568 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TESCQ96BS2 214 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TOX2Q96NM4 488 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF347Q96SE7 839 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 DLGAP1O14490 977 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 PDE9AO76083 593 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SELENOWP63302 87 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SYPL1Q16563 259 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 DPPA4Q7L190 304 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 HMGB4Q8WW32 186 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 DNASE1L2Q92874 299 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 SMARCD2Q92925 531 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 OR51V1Q9H2C8 321 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 MKLN1Q9UL63 735 aa11.97□□□□□ -0.49
UBXN4-201ENST00000272638 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms