RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530295.5

NDUFS3-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, human

TSL 3

Gene NDUFS3, Length 253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS3-208	ENST00000530295	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM222B	Q8WU58	562 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR4K3	Q96R72	315 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SARG	Q9BW04	601 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	MYOT	Q9UBF9	498 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295		A0A0G2JN53	185 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	HAUS5	O94927	633 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	IFNA16	P05015	189 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TPSB2	P20231	275 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SAT1	P21673	171 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	BMP5	P22003	454 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CASQ1	P31415	396 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	PEX19	P40855	299 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SCTR	P47872	440 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	VPS41	P49754	854 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPR143	P51810	404 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	BTN3A2	P78410	334 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CDK16	Q00536	496 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TERF2	Q15554	542 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CCNG2	Q16589	344 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	RTL4	Q6ZR62	310 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SCYL1	Q96KG9	808 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	NDN	Q99608	321 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	C4orf51	C9J302	202 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SUSD5	O60279	629 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295		P04436	131 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	GABRA1	P14867	456 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TACR1	P25103	407 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	AHR	P35869	848 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SP140	Q13342	867 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAR2	Q96K12	515 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NDUFS3-208	ENST00000530295	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLDN4	O14493	209 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	DVL2	O14641	736 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	GUCA1C	O95843	209 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	PCSK6	P29122	969 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	HOXC12	P31275	282 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	ASCL1	P50553	236 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	HK2	P52789	917 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NDUFS3-208	ENST00000530295	FOXO1	Q12778	655 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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