RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	PHO23	P50947	330 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	BI4	P03879	638 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	MCM7	P38132	845 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	ACM1	Q08981	209 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	GNT1	Q12096	491 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	RAD27	P26793	382 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	SLA2	P33338	968 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	RRT14	P40470	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	HFM1	P51979	1187 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HIT1	YJR055W	DCG1	P32460	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	PEP7	P32609	515 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	GEM1	P39722	662 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	AIM21	P40563	679 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	MND2	P40577	368 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	TPO1	Q07824	586 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	CHS7	P38843	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	PNT1	P38969	423 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	PLB1	P39105	664 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	CTF4	Q01454	927 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	ADY3	Q07732	790 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	XYL2	Q07993	356 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	DUT1	P33317	147 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	MET12	P46151	657 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	MTC3	P53077	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	LYP1	P32487	611 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	POA1	P38218	177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	MSS4	P38994	779 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	KIN4	Q01919	800 aa		4.17	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
HIT1	YJR055W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	HIS5	P07172	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	CHA4	P43634	648 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	EEB1	Q02891	456 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HIT1	YJR055W	INO1	P11986	533 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	ENA1	P13587	1091 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YAP1801	P38856	637 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	RMD1	Q03441	430 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	RAD53	P22216	821 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YKL151C	P36059	337 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	EXG2	P52911	562 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	OSW2	Q12202	724 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	RKM4	Q12504	494 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	CDC34	P14682	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	IOC3	P43596	787 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	TYW3	P53177	273 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	HEM3	P28789	327 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YPT53	P36019	220 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YGL176C	P46945	554 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YGR012W	P53206	393 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	CDA1	Q06702	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	MDM38	Q08179	573 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YKL107W	P34251	309 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	MET10	P39692	1035 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YML020W	Q03722	664 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	SPE1	P08432	466 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	SRP101	P32916	621 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	PET112	P33893	541 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	GIC1	P38785	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	SRT1	Q03175	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	AIM39	Q08223	395 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	LAS17	Q12446	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HIT1	YJR055W	HSF1	P10961	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	FUN30	P31380	1131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	SPO20	Q04359	397 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	PPM2	Q08282	695 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	NPC2	Q12408	173 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	ASF1	P32447	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	MNR2	P35724	969 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	OAR1	P35731	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HIT1	YJR055W	MOH1	P38191	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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