RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	SPO20	Q04359	397 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	ATG13	Q06628	738 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	RKM4	Q12504	494 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YKL107W	P34251	309 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	VPS16	Q03308	798 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	DUS4	Q06063	367 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	MAD1	P40957	749 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	HFM1	P51979	1187 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	CWC24	P53769	259 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.32	□□□□□ -1.56	not detected
PEX18	YHR160C	YKL151C	P36059	337 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	MTC3	P53077	123 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	XYL2	Q07993	356 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	PIN2	Q12057	282 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	CLN2	P20438	545 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	GCV2	P49095	1034 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	MSC2	Q03455	724 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	SIZ1	Q04195	904 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	YLR358C	O13565	187 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	MBP1	P39678	833 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	RRT14	P40470	206 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	GPB1	Q08886	897 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	CDC6	P09119	513 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	PRI2	P20457	528 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	CDC20	P26309	610 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	YKL069W	P36088	180 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.28	□□□□□ -1.56	not detected
PEX18	YHR160C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	SVF1	Q05515	481 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	RXT3	Q07458	294 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	OPI10	Q08202	246 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PEX18	YHR160C	AGP1	P25376	633 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	TAT2	P38967	592 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	EMC1	P25574	760 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	CTS1	P29029	562 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	DOM34	P33309	386 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.26	□□□□□ -1.57	not detected
PEX18	YHR160C	VAC8	P39968	578 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	YAP6	Q03935	383 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	MDM38	Q08179	573 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	LST4	P34239	828 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	VBA5	P36172	582 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	YAP1801	P38856	637 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	MND2	P40577	368 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	VPS62	P53285	467 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	HMI1	Q12039	706 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	OSW2	Q12202	724 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	ENA1	P13587	1091 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	GIC1	P38785	314 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	NPP2	P39997	493 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	TMA10	Q06177	86 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	SRT1	Q03175	343 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	TPO1	Q07824	586 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	YLR224W	Q05947	369 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	YLL058W	Q12198	575 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PEX18	YHR160C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	SRP101	P32916	621 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	SFB2	P53953	876 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	SHE9	Q04172	456 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	ADY3	Q07732	790 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	POA1	P38218	177 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	CDA1	Q06702	301 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	FUN30	P31380	1131 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	STE5	P32917	917 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	PLB1	P39105	664 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	MET12	P46151	657 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	YGR012W	P53206	393 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	YDR306C	Q06640	478 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
PEX18	YHR160C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PEX18	YHR160C	HIS5	P07172	385 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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