RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637524.1

U6.99-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.99-201ENST00000637524 PRR20DP86480 221 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 PRR20BP86481 221 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 PRR20AP86496 221 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 CENPCQ03188 943 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MMRN1Q13201 1228 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 COX20Q5RI15 118 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.83□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 UNCXA6NJT0 531 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TNFRSF10BO14763 440 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 NDUFB5O43674 189 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TIMP2P16035 220 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 BRD2P25440 801 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 RTN1Q16799 776 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ITPKCQ96DU7 683 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 NLRP3Q96P20 1036 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 BCL11AQ9H165 835 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MPSTP25325 297 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 USP5P45974 858 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 WDR4P57081 412 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 CBLBQ13191 982 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 PDE3BQ13370 1112 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MTMR3Q13615 1198 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 HIF1AQ16665 826 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 CYP4X1Q8N118 509 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MEIOBQ8N635 442 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 FAM129BQ96TA1 746 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.81□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TREHO43280 583 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 FZD6O60353 706 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 IGHA2P01877 340 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ITGAEP38570 1179 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 DSC3Q14574 896 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 WDR44Q5JSH3 913 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TMC7Q7Z402 723 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 GIPC2Q8TF65 315 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 L3MBTL2Q969R5 705 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 USP3Q9Y6I4 520 aa4.8□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 J3QL48 77 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 SPINT1O43278 529 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 SMPD1P17405 629 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 FOXC1Q12948 553 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 TBCELQ5QJ74 424 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 CABP1Q9NZU7 370 aa4.79□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 RGS20O76081 388 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 PLCB3Q01970 1234 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 GNASQ5JWF2 1037 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 IER5Q5VY09 327 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 GJD3Q8N144 294 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.78□□□□□ -1.64
U6.99-201ENST00000637524 MEN1O00255 615 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 RELBQ01201 579 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 EHHADHQ08426 723 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 IFT43Q96FT9 208 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 PHACTR1Q9C0D0 580 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.77□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 ZBTB39O15060 712 aa4.76□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 P4HBP07237 508 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 PCSK2P16519 638 aa4.76□□□□□ -1.65
U6.99-201ENST00000637524 DGKZQ13574 1117 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms