RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614476.4

MTERF4-222, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MTERF4, Length 4,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-222	ENST00000614476	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78	1e-6	■□□□□ 10.6
MTERF4-222	ENST00000614476	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	PTPRC	P08575	1304 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	PSMA5	P28066	241 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	PDE1A	P54750	535 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MTERF4-222	ENST00000614476	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ADGRB3	O60242	1522 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	TBX22	Q9Y458	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CEP152	O94986	1710 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	IGSF3	O75054	1194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CCP110	O43303	1012 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ABCA6	Q8N139	1617 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CAVIN2	O95810	425 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	IL13	P35225	146 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CAMK4	Q16566	473 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	F13A1	P00488	732 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ABCC4	O15439	1325 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	PTGS1	P23219	599 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	FLT4	P35916	1363 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	BTBD11	A6QL63	1104 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	GJB2	P29033	226 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	AK7	Q96M32	723 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	MEIS3	Q99687	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ZNF165	P49910	485 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476		F6X3S4	739 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MTERF4-222	ENST00000614476	HIP1	O00291	1037 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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