RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598415.5

DEDD2-208, Transcript of death effector domain containing 2, human

TSL 2

Gene DEDD2, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DEDD2-208	ENST00000598415	COL15A1	P39059	1388 aa		30.15	■■■□□ 2.42
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
DEDD2-208	ENST00000598415	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
DEDD2-208	ENST00000598415	GPR162	Q16538	588 aa		30.14	■■■□□ 2.42
DEDD2-208	ENST00000598415	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	ZPR1	O75312	459 aa		30.12	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	30.12	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	FKBP8	Q14318	412 aa		30.11	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	30.11	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		30.1	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		30.09	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		30.09	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	30.09	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		30.09	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	NARF	Q9UHQ1	456 aa		30.09	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	YY1	P25490	414 aa		30.08	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		30.08	■■■□□ 2.41
DEDD2-208	ENST00000598415	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	RIPK4	P57078	832 aa		30.07	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		30.07	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	30.06	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	USP16	Q9Y5T5	823 aa		30.06	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		30.05	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		30.05	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	A1BG	P04217	495 aa		30.05	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		30.05	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	CHD4	Q14839	1912 aa		30.04	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415		A0A087WZG4	1122 aa		30.04	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	30.04	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	RUNDC1	Q96C34	613 aa		30.04	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	UTRN	P46939	3433 aa		30.03	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	30.03	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	DDR1	Q08345	913 aa		30.03	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	30.03	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		30.02	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		30.02	■■■□□ 2.4
DEDD2-208	ENST00000598415	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		30.01	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	TM4SF1	P30408	202 aa		30.01	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		30.01	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	SCN7A	Q01118	1682 aa		30.01	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		29.99	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.98	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	TGFB2	P61812	414 aa		29.98	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	NFIX	Q14938	502 aa		29.98	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	NEUROD2	Q15784	382 aa		29.98	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		29.97	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.95	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		29.95	■■■□□ 2.39
DEDD2-208	ENST00000598415	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.95	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		29.94	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415		A0A0G2JLW4	131 aa		29.92	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		29.92	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	CAMTA2	O94983	1202 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	DPEP1	P16444	411 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.91	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	ANP32C	O43423	234 aa		29.9	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	SERPINB2	P05120	415 aa		29.9	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.9	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		29.9	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	CCDC184	Q52MB2	194 aa		29.89	■■■□□ 2.38
DEDD2-208	ENST00000598415	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.85	■■■□□ 2.37
DEDD2-208	ENST00000598415	APAF1	O14727	1248 aa		29.84	■■■□□ 2.37
DEDD2-208	ENST00000598415	KCNA3	P22001	575 aa		29.84	■■■□□ 2.37
DEDD2-208	ENST00000598415	BCS1L	Q9Y276	419 aa		29.84	■■■□□ 2.37
DEDD2-208	ENST00000598415	CHL1	O00533	1208 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	SETDB2	Q96T68	719 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	CHRNA5	P30532	468 aa		29.81	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	PIM2	Q9P1W9	311 aa		29.81	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.79	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	RGL2	O15211	777 aa		29.79	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	NGEF	Q8N5V2	710 aa		29.79	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	MRS2	Q9HD23	443 aa		29.79	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		29.79	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	MYL6B	P14649	208 aa		29.78	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DEDD2-208	ENST00000598415	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
DEDD2-208	ENST00000598415	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
DEDD2-208	ENST00000598415	CNBD1	Q8NA66	436 aa		29.75	■■■□□ 2.35

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